不同忍者的技能机制决定了其战斗表现。阿飞作为A级忍者，凭借空中滑翔和地雷原术的消耗能力，在决斗场中表现出色。他的技能设置炸弹大成功兼具防御与起手功能，可躲避地面技能并半屏突袭，配合扦插之术等秘卷能形成强力控制链。但需注意空中飞行高度较低，易被迪达拉、宇智波鼬等角色的空中技能打断。
仙人兜的白激之术具备远距离脱手吸附特性，是优秀的起手技能。其常态二技能的骨刀连段可快速积累能量点，切换至黑夜模式后，奥义技能配合多由也二连段能实现高爆发输出。该忍者的核心在于能量管理，需通过合理切换形态维持战斗节奏。黑夜模式下的滴水与心跳音效为操作提供了额外反馈，有助于判断技能衔接时机。
蝎绯流琥的双形态机制带来丰富战术选择。绯流琥形态的毒针千本与尾刃切割附带持续中毒效果，三代风影形态则依靠砂铁时雨和铁砂界法实现范围压制。耐久度能量条的设计要求玩家精准计算受击次数，避免过早强制切换形态。奥义重刃库轰炸的多段攻击能叠加中毒与灼烧，对残血敌人威胁极大。
武当花火通过阴阳能量系统展现独特战斗风格。她的技能需平衡虚实剑气条，满1.5格时激活强化技能。太极武学与现代忍术的结合使其具备灵活的位移与控制能力，但操作复杂度较高。秽土鼬的天照与十拳剑组合兼顾爆发与控场，须佐能乎状态下的八坂之勾玉可远程消耗。该忍者对替身术时机要求严格，需预判对手行动以发挥技能最大收益。而宇智波泉奈的瞳力机制强化了二技能效果，瞬身斩击附带无敌帧的特性使其在近身战中占据优势。
