黑塔空间站的宝箱主要分布在基座舱段、收容舱段和支援舱段这三个核心区域，部分后续版本更新后，禁闭舱段也分布有宝箱。不同资料统计的总数在39个至46个之间，存在差异的原因可能与游戏版本更新及统计口径有关，例如有些宝箱被归类为隐藏或任务宝箱。
基座舱段是玩家早期探索的区域，这里的宝箱数量大约在10到11个。大部分宝箱可以直接开启或击败守卫怪物获得，但其中有部分属于特殊宝箱，需要完成特定的支线任务才能解锁，例如收集三张密钥的任务。探索时需要注意楼梯转角、二楼房间以及地图最下方等不太显眼的位置。
收容舱段和支援舱段是宝箱分布较为密集的区域。收容舱段分为两层，总计约有16到20个宝箱，其中一些宝箱需要通过解谜或完成指定支线任务后才会出现。支援舱段则有13到17个宝箱，这个区域的宝箱与主线任务的关联性非常强，例如触不可及和人非草木系列任务会直接关系到多个宝箱的解锁，如果发现宝箱点位无法互动，通常是因为相关的前置任务还未完成。
探索时还有一些通用的注意事项。空间站内存在一种名为次元扑满的特殊敌人，击败它可以获得类似宝箱的奖励，但它被发现后会逃跑，需要及时攻击或之后重新传送回来寻找。建议按照基座舱段、收容舱段、支援舱段的顺序系统探索，并利用地图界面自带的宝箱计数器功能来查漏补缺，部分宝箱可能藏在绿植后方、展台下方等视觉盲区。
