驯服古神翼龙前，需要针对其胆小警觉的特性进行充分的物资准备，核心物资包括一套吉利服、至少一个流星锤以及高效的击晕工具与合适食物。吉利服能有效降低你被发现的概率，是安静接近的前提。击晕工具推荐使用生效更快的麻醉镖，其次为麻醉箭，以应对其短暂的定身时间。食物方面，最优选择是异特龙蛋饲料，它能极大提升驯服效率；若无饲料，则需准备优质生肉、优质熟肉或优质鱼肉作为替代，生肉的驯服效果最差应尽量避免。
成功的驯服始于隐秘的接近过程，发现古神翼龙后必须保持距离并下蹲缓慢移动。古神翼龙是一种被动逃跑型生物，任何贸然的靠近都会导致其立刻飞走，因此穿着吉利服并从其视野盲区蹲伏前进是标准操作。当你接近到约三至五米的距离时，应迅速投掷流星锤将其暂时束缚在原地，这个定身效果大约持续三十秒，你必须在此时间内完成击晕。另一种策略是服用稀有花朵，吸引古神翼龙主动飞近攻击，这能提高流星锤命中的容错率。
在古神翼龙被流星锤定身后，需立即使用麻醉武器进行击晕，目标是在其挣脱前清空其眩晕条。射击时应优先瞄准头部以获取更高的眩晕值加成。由于其挣脱后便会逃离且难以再次捕捉，因此击晕过程要求快速而准确。击晕成功后，需立即在它周围搭建木质拒马等障碍物将其保护起来，以防在漫长的驯服过程中被其他野生食肉动物攻击。同时要持续关注其眩晕值，通过喂食黑色浆果或麻醉药来维持昏迷状态，防止其提前苏醒。
完成防护后，将优先级的食物放入古神翼龙的物品栏中，它便会自动进食以增长驯服进度。整个喂食过程需要耐心等待，期间仍需注意维持其眩晕值。驯服进度受古神翼龙个体等级影响，等级越高所需时间越长，但驯服后的基础属性也更好。驯服成功后，你需要达到55级解锁并制作古神翼龙鞍具，装备上方可骑乘。该鞍具支持三人同时骑乘，分为一个驾驶位和两个射击位，具备独特的战术价值。古神翼龙作为飞行坐骑，拥有极高的机动性与特殊能力。骑乘时，它可以向任意方向飞行，甚至能够垂直升降。
